Per ridurre gli impulsi, diverse pompe peristaltiche sono dotate di un meccanismo a molla che garantisce un'azione di pompaggio uniforme. Questa caratteristica è importante anche per i fluidi sensibili al taglio, come ad esempio le cellule vive. Un altro aspetto da considerare è la regolazione della pompa rispetto alle diverse dimensioni dei tubi in funzione della portata necessaria.
Le tipologie di pompe più sofisticate sono anche provviste di occlusione regolabile. Questa caratteristica consente di regolare la pompa in base ai diversi livelli di pressione che potrebbero presentarsi nei sistemi fluidici. Inoltre, permette di adattare le prestazioni della pompa a tubi materiali diversi. A seconda del tipo di fluido, vengono utilizzati tubi in silicone, più morbidi; nelle applicazioni più complesse con sostanze chimiche, invece, occorre utilizzare materiali fluoroelastomerici, di solito molto più rigidi.
Le pompe peristaltiche si distinguono per la loro facilità di utilizzo. Sia i tubi che la testa della pompa possono essere sostituiti in pochissimi secondi. Il design privo di valvole interne presenta numerosi vantaggi. Il funzionamento può essere sia in senso orario che antiorario, in modo tale che il trasferimento dei liquidi avvenga in entrambe le direzioni, se così è previsto dalla procedura. L'assenza di valvole fa sì che i tubi presentino meno limitazioni, una caratteristica che agevola il trasferimento di fluidi viscosi.
Per incrementare l'efficienza di prodotto, è possibile utilizzare pompe peristaltiche multicanale, in cui un motore aziona la testa di una pompa con un massimo di 15 canali, ciascuno di essi dotato di un tubo. Questo tipo di pompe permette di trasferire diversi fluidi contemporaneamente oppure di distribuire lo stesso fluido in diversi recipienti. Il numero di rulli utilizzati nelle pompe peristaltiche influisce enormemente sulla movimentazione dei fluidi. Per valori di portata elevati, vengono utilizzati solo due o tre rulli. L'aspetto negativo è che aumentano gli impulsi. Se occorre che il fluido venga trasferito con delicatezza, spesso vengono utilizzati più rulli affinché il livello di impulsi si mantenga moderato.
Un requisito importante di molte procedure mediche o analitiche è l'assenza di contaminazione incrociata. I tubi sono gli unici elementi a contatto con il fluido e possono essere facilmente scollegati al termine di ogni ciclo di processo.
Tra le altre applicazioni, vi sono la distribuzione di detergenti nelle lavastoviglie industriali, la rimozione della condensa nei sistemi di monitoraggio continuo delle emissioni o il trasferimento di dialisato nelle macchine per dialisi.